У кишечнику людини в нормі живуть не тільки бактерії (мікробіом), а й віруси (віром), переважно бактеріофаги. Але як вони взаємодіють із бактеріями, поки не дуже зрозуміло

На сьогодні вчені не так багато знають про кишковий мікробіома, але про віром відомо ще менше. Щоб дізнатися більше, дослідники з Університету Корку (Ірландія) вивчали кишковий віром дев'яти осіб протягом року та одну людину – протягом двох років. Вони встановили, що у кишечнику людини живе багато типів бактеріофагів та їх склад індивідуальний.

В результаті дослідження було створено базу даних кишкових бактеріофагів, яка може значно поглибити наше розуміння того, як фаги впливають на здоров'я людини. Отримані дані показують, що на відміну мікробіома, склад якого в різних людей багато в чому збігається, віром значно варіює. Це означає, що одні й самі бактерії в різних індивідів є господарями різних бактеріофагів.

У дослідженні* збирали зразки калу 10 осіб – 4 чоловіків та 6 жінок – щомісяця протягом року. В однієї жінки зразки додатково отримали на 19, 20 та 26 місяць спостереження. Зі зразків виділяли вірусні частинки і визначали послідовність вірусного геному. Так як 99% кишкових вірусів невідомі науці, визначити їх поки що немає можливості. Тому вчені зайнялися пошуками кодуючих послідовностей вірусної ДНК та аналізом білків, які можуть кодувати, та їх збігів з білками в існуючих базах даних. Вчені виявили, що у вірому представлено багато вірулентних бактеріофагів – таких, які для розмноження потребують знищення бактерії-господаря.

Поки мікробіологи дуже мало знають про взаємодію бактеріофагів та кишкових бактерій людини, але, безсумнівно, дослідження мікробіом у нормі та при патології вимагають також вивчення вірому. Було б корисно з'ясувати, як виглядає вірою здорової людини, як вона залежить від способу життя, місця проживання, етнічної приналежності тощо. З'ясувавши, що є нормою, легше буде розібратися з патологічними станами, пов'язаними зі зміною складу вірусів у кишечнику.

* Shkoporov A., Clooney AG, Sutton TDS та ін. Human gut virome є високою різновидом, стабільним, і індивідуальним специфічним // Cell Host & Microbe, 2019, 26 (4): P527-541.E5. DOI: https://doi.org/10.1016/j.chom.2019.09.009